Por: Hernán Aguirre.
Los virus como COVID-19 tienden a propagarse de manera exponencial si no se toman medidas apropiadas en los estados tempranos de una epidemia.
Los modelos compartimentales SIR (Susceptibles, Infectados, Recuperados) son útiles para estudiar y predecir la propagación de enfermedades infecciosas con el afán de evaluar escenarios de mitigación. Un modelo SIR multi-población es una variante que permite simular la propagación simultánea de una infección en varias poblaciones conectadas a través de una red de transporte.
El artículo que se incluye a continuación reporta simulaciones iniciales con un modelo SIR multi-población para ilustrar posibles escenarios de propagación del COVID-19 en las distintas provincias del Ecuador. El objetivo de este trabajo es proveer información útil que ayude en la toma de decisiones para mitigar la propagación del virus y sus efectos.
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COVID-19-Ecuador_v1903_r2103.pdfCOVID-19-Ecuador_v1903_r2103.pdf
Comentarios al Reporte y Sugerencias
«Quizá dos comentarios que pueden ser útiles:
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La teoría de las epidemias define como punto de partida que toda epidemia tiene un ciclo sin intervención alguna, debido a que a medida que aumentan los infectados, incrementan los inmunes (Su cálculo se basa en el supuesto que el virus genera inmunidad permanente, ese es un tema en estudio aún, pero es correcto).
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El segundo tema de debate es que el problema de esta infección (desde el punto de vista epidemiológico) no es el número de infectados, sino la virulencia, es decir la capacidad de generar caso graves y fatales (por el cálculo de camas hospitalarias) que es el gran conflicto en España y claro la tasa de letalidad.
Quizá vale que le maticen sus resultados con estas reflexiones. Eso permite entender que en cada uno de los escenarios deberíamos estimar que el 5% (más o menos, quizá con el pasar del tiempo ese porcentaje disminuya) requerirá hospitalización y entre el 2 al 3% morirá.
No quita en nada el alarmante impacto de la enfermedad, pero no es lo mismo tener pánico por 2,5 millones que por 150.000 hospitalizados en 200 días. Qué opinas?»
Se debería crear escenarios más relajados, por ejemplo de infectados al 15%.
Publique en espacios científicos, pocos pueden leer adecuadamente pero si pueden elucubrar y malinterpretar.
Respuesta: Tiene razón, muchos podrían mal interpretar el contenido del reporte. Siempre publico en espacios científicos. Sin embargo, son tiempos escepcionales. Las opiniones que se incluyen tienen fundamentos, espero que genere un debate positivo y sirva para tomar decisiones acertadas.
Pudiera resumir el escenario de proyección actual con las medidas implementadas ? Cuánto tiempo podemos sostener la cuarentena domiciliaria y los viajes interprovinciales ?
Respuesta: Sus preguntas son muy buenas. Para poder contestarle apropiadamente necesitamos saber el grado de aislamiento de infectados y rectricción de movilidad real que ahora existe en Ecuador. Se deberá monitorear cercanamente la curva de casos reportados para ajsutar las medidas.
Si dispones en Phyton lo puedo traducir a R. Quisiera ver el código del modelo de regresión para obtener los parámetros.
Respuesta: Sí, el código está en Python. El código lo está revisando un colega y lo estaremos liberando muy pronto.
La regresión la efectúo usando un algoritmo evolutivo simple. El algoritmo busca valores óptimos de dos variables, alpha y beta, de tal forma que minimize el error entre lo que el modelo estima y el número de casos reportados tomando en cuenta tanto Infectados como Recuperados.
No es imprescindible usar un algoritmo evolutivo para la regresión. Se puede usar cualquier algoritmo de regresión.
La figura de la abajo muestra la función de evaluación del error que usa el algoritmo.
Leyendo el trabajo, tengo varias preguntas.
En las conclusiones puedo apreciar que en el mejor de los casos (retrasar el contagio a dos años y teniendo un pico de 700k contagiados al mismo tiempo) nuestro sistema de salud colapsaria de igual manera.
¿Que otras simulacione se han hecho?. ¿El país puede sobrellevar una para total sin un fondo monetario de reserva para emergencias?, Actualmente el crecimiento del virus lleva una problemática de contagio de 1.30aprox, (P=Casos actual/Casos ayer)
¿Que simulaciones quedaron pendientes o faltante?
Respuesta: De las simulaciones reportadas, el escenario VII es el único que evita crecimiento exponencial. Sin embargo, requiere que las medidas se apliquen permanentemente. Estamos buscando escenarios alternativos. Haremos un apéndice al reporte inicial en los proximos días.
https://sites.google.com/view/lia-modo-covid-19-ecuador/
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